Après quelques utilisations, le filtre à mèche peut former un dépôt blanc ou jaune. Ce dépôt et ces taches sont dus à des dépôts minéraux et autres débris provenant de l'eau de remplissage de l'humidificateur et retenus par le filtre à mèche.

Pour nettoyer, retirez le filtre à mèche de son support et rincez-le à l'eau courante. Pour un nettoyage plus approfondi, faites-le tremper dans un nettoyant doux ou à base d'acide citrique (20 g d'acide citrique pour 1 L d'eau) pendant 1 heure, puis rincez abondamment à l'eau courante conformément aux instructions du manuel d'utilisation.